endogēnā infekcija — organisma pašinficēšanās ar savu normālo mikrofloru, kas parastos apstākļos saslimšanu nerada. AUTOINFEKCIJA cēlonis var būt jebkuri nosacīti patogēnie mikrobi (stafilokoki, zarnu nūjiņas, patogēnās sēnes). kas lielā vairumā veģetē uz ādas, elpošanas ceļu, gremošanas orgānu, urīnceļu gļotādas. Dažādi nelabvēlīgi faktori (badošanās, strauja meteoroloģisko un klimatisko apstākļu maiņa, vielmaiņas traucējumi) samazina organisma pretestību un rada labvēlīgus apstākļus šās nosacīti patogēnās mikrofloras aktivitātei. Tā sāk pastiprināti vairoties un izraisa patol. procesu.